Acquisto e trasporto piante, quando occorre l'Intrastat

Un mio cliente commercia, sia all'ingrosso che al dettaglio, piante e fiori freschi. Acquista, nei Paesi Bassi, piante per circa 300mila euro all'anno. Riceve la merce con lettera di vettura. Successivamente, riceve la fattura cartacea, emette autofattura per la merce, con Iva al 10 per cento, e autofattura per spese di trasporto e spese imballaggi, con Iva al 22 per cento. Di seguito, integra la fattura cartacea con Iva al 22% per le spese e al 10% per la merce. Da quando emette autofattura allo Sdi (sistema di interscambio), il soggetto in questione non presenta più il modello Intrastat. È corretto questo comportamento, oppure avrebbe dovuto continuare a presentare il modello citato?