Retroattività del vincolo sulla casa costruita in precedenza

I miei genitori abitano in un sottotetto del quale sono proprietari. Tale immobile, costruito all'inizio degli anni 80 e acquistato nel 1983, si trova in una zona che dal 1985 è a vincolo paesaggistico. Nel 1995 questo sottotetto è stato riaccatastato con differente destinazione d'uso e i miei genitori hanno sempre pagato le tasse per un immobile civile, che il Comune non ha contestato. Circa otto anni fa, tuttavia, i vigili hanno sequestrato l'immobile e denunciato mio padre. Dopo un lungo iter, con multe (che abbiamo saldato), il Comune ci ha rilasciato il permesso in sanatoria, rigettato però dalla Sovrintendenza per il vincolo paesaggistico. Un vincolo adottato nel 1985 può essere retroattivo, annullando un permesso in sanatoria? La situazione come può essere sanata?