Bonus Sud e attività residuale di trasporto per conto terzi

Una ditta individuale esercita più attività (movimento terra, commercio all'ingrosso di materiali di recupero non metallici, noleggio di macchine e attrezzature per lavori edili con e senza operatore) e in via residuale - nella misura del 3% su un fatturato di oltre un milione di euro - l'attività di trasporti conto terzi. La ditta non ha tenuto contabilità separata per tali prestazioni, ma le fatture relative al trasporto sono poche e facilmente dimostrabili. Negli anni dal 2017 al 2022, la ditta ha acquistato diversi macchinari e impianti, perlopiù fissi a terra, ottenendo e utilizzando il credito d'imposta per il Mezzogiorno. In sede di controllo, dimostrando la non attinenza degli investimenti fatti rispetto alla residuale attività di trasporto, possono esserci difficoltà?